2011年，撤销曹村镇、梅屿乡、大南乡、顺泰乡，并入马屿镇。调整后，马屿镇辖5个居民区、132个行政村。镇政府驻马北村。330省道过境。
原马屿镇位于瑞安市南部，飞云江中游。东北靠荆谷乡、东接江溪镇，南邻篁社镇，西接顺泰乡、平阳坑镇，北濒飞云江，并界梅屿乡。面积60.2平方千米，人口7.09万人（2008年末）。辖文昌、东司桥、莲子河3个居民区，马北、马南、马岩、五甲、团社、树排头、上安、垟下、焦坑、九甲、永丰、石牌、净水、水坑、山后、上洞、湖头、村前、一甲、格利、东山头、藤岙、潘山、朱岙底、外垟、底山、大垄头、五仁山、江浦、后姜、上郑、黄甲、江东、江西、吴堡、上京、姜家汇、冯桥、黄桥、会东、三株松、龟山下、吉南、玉岙、蜇丰、 鹤一、鹤二、江桥、高岙、篁屿、石垟、山河、村口、河岙底、青石桥、增光垟、马岙、协山58个行政村。镇政府驻马北村，距城区20千米。 【沿革】因镇西有龟、蛇二山，合称马屿山，故名。明嘉靖时属安仁乡四十二都和四十三都。1930年属来安区，1931年称马屿乡，1935年属来安、沿厚两乡，1946年为马屿镇及锦浦乡。1949年称马屿镇，1952年分置马屿镇及马屿乡。1956年凤鸣、篁社、马屿三乡并入马屿镇，同年10月凤鸣、望社两乡又析出。1958年为马屿管理区，1961年为马屿公社，1984年复置马屿乡，1985年撤乡设镇，1992年原江浦乡，清垟乡并入马屿镇。1949年至1992年镇建成区为马屿区公所驻地。1997年，面积40.9平方千米，人口5.5万，辖东司桥、文昌、莲子湖3个居委会和玉岙、蛰丰、吉南、会东、龟山下、三株松、冯桥、江浦、姜家汇、江东、江西、后姜、上郑、黄甲、五堡、上京、黄桥、山后、树排头、团社、五甲、马南、马北、马岩、九甲、石牌、垟下、永丰、水坑、焦坑、上安、净水、上洞、藤岙、湖头、东山头、村前、朱岙底、格利、乙甲、潘山、外垟、大龙头、五层山、底山45个行政村，镇政府驻双屿南路。2000年8月，撤销马屿镇、篁社镇建制，合并设立新的马屿镇。调整后的马屿镇辖58个行政村、3个居民区，镇政府驻马北村。 【邮编】325208 【2010年代码及城乡分类】330381116：～001 123文昌居委会 ～002 123东司桥居委会 ～003 123莲子湖居委会 ～200 220蜇丰村 ～201 220玉岙村 ～202 220吉南村 ～203 220会东村 ～204 220龟山下村 ～205 220三株松村 ～206 220冯桥村 ～207 220江浦村 ～208 220姜家汇村 ～209 220江东村 ～210 220江西村 ～211 220后姜村 ～212 220上郑村 ～213 220黄甲村 ～214 220吴堡村 ～215 220上京村 ～216 220黄桥村 ～217 220山后村 ～218 220树排头村 ～219 220团社村 ～220 122五甲村 ～221 122马南村 ～222 121马北村 ～223 122马岩村 ～224 122九甲村 ～225 220石牌村 ～226 220垟下村 ～227 220永丰村 ～228 220焦坑村 ～229 220上安村 ～230 220净水村 ～231 220上洞村 ～232 220水坑村 ～233 220湖头村 ～234 220藤岙村 ～235 220东山头村 ～236 220朱岙底村 ～237 220格利村 ～238 220乙甲村 ～239 220村前村 ～240 220潘山村 ～241 220外垟村 ～242 220大龙头村 ～243 220五仁山村 ～244 220底山村 ～245 220篁社村 ～246 220高岙村 ～247 220山河村 ～248 220增垟村 ～249 220岳一村 ～250 220岳二村 ～251 220协山村 ～252 220马岙村 ～253 220河岙村 ～254 220村口村 ～255 220石桥村 ～256 220江桥村 ～257 220石垟村
原篁社镇位于瑞安市区西南18千米，东靠江溪镇，南邻曹村镇，本接大南乡，西北界马屿镇。地处马曹三角河谷平原中心地带天井垟腹地，地势低洼，河道纵横。面积17.4平方千米，人口1.75万人，辖篁社、高岙、山河、增洋、鹤一、鹤二、协山、马岙、河岙、村口、石桥、江桥、石垟13个行政村，镇政府驻鹤一村。明嘉靖时属来暮乡四十都。1931年属风翔、河山、民生三乡；1935年合并为凤鸣乡；1946年属仙降区马屿镇。1949年6月并入马屿区曹许乡，同年9月复置凤鸣乡；1950年析为凤鸣、篁社2乡；1956年2月并入马屿镇，同年9月析置望社乡；1958年称篁社管理区；1961年称篁社公社，1984年复称篁社乡。1990年撤乡建镇。2000年撤镇并入马屿镇。
原曹村镇位于瑞安市中部南端，南邻平阳县。镇域三面环山。面积36.2平方千米，人口2.73万人（2008年末）。辖太平桥、曹川2个居民区，曹东、曹南、曹西、曹北、姜山、女岙、许南、许北、大板桥、宋岙、丁凤、曹平、东岙、西前、上都、南岙、南堡、碗窑18个行政村。镇政府驻曹东村，距市城区28千米。 【沿革】1946年建乡，1949年改为公社，1984年建乡，几经变更，1987年改为建制镇。1996年，面积39.7平方千米，人口2.6万，辖太平桥、曹川2个居委会和曹南、曹东、曹西、曹北、西前、上都、南堡、碗窑、东岙、南岙、丁岙、宋岙、大板桥、女岙、许北、许南、姜山、曹平18个行政村。 【邮编】325208 【2010年代码及城乡分类】330381118：～001 123太平桥居委会 ～002 123曹川居委会 ～200 122曹东村 ～201 121曹南村 ～202 122曹西村 ～203 122曹北村 ～204 122上都村 ～205 122西前村 ～206 220南堡村 ～207 220碗窑村 ～208 220南岙村 ～209 220东岙村 ～210 220丁凤村 ～211 220宋岙村 ～212 220大板桥村 ～213 220女岙村 ～214 220许南村 ～215 220许北村 ～216 220姜山村 ～217 122曹平村
原梅屿乡位于瑞安市飞云江中游北岸，南有马屿飞云江大桥与马屿镇相接。面积37.4平方千米，人口2.42万人（2008年末）。辖屿头、五云、梅岭头、上平坑、金竹湾、大田平、大岙底、洞桥、外山头、河溪、底三甲、外三甲、梅底、先岙、马岭斡、马下、马中、马上、宫后、杨巷、霞岙、柴上、柴下、冯渡24个行政村。乡政府驻屿头村。 【沿革】l949年设梅屿乡，以乡内梅底、屿头2村名各取首字命名。1951年环山乡并入。1958年称梅屿管理区，属马屿（大）公社。1961年改称梅屿公社，1984年建乡。1997年，面积41.5平方千米，人口2.3万，辖柴上、柴下、场巷、马屿斡、霞岙、桐桥、宫后、冯渡、马上、马中、金竹湾、梅岭头、马下、外三甲、底三甲、河溪、上平坑、大田坪、屿头、梅底、先岙、外山头、大岙底、五云24个行政村，乡政府驻屿头村。 【邮编】325208 【2010年代码及城乡分类】330381202：～200 220柴上村 ～201 220柴下村 ～202 220杨巷村 ～203 220霞岙村 ～204 220宫后村 ～205 220冯渡村 ～206 220马上村 ～207 220马中村 ～208 220马下村 ～209 220外三甲村 ～210 220底三甲村 ～211 220河溪村 ～212 210屿头村 ～213 220梅底村 ～214 220先岙村 ～215 220马屿斡村 ～216 220外山头村 ～217 220大岙底村 ～218 220金竹湾村 ～219 220梅岭头村 ～220 220上平坑村 ～221 220大田平村 ～222 220桐桥村 ～223 220五云村
原顺泰乡位于瑞安市西南、飞云江中游北岸。面积29.9平方千米，人口1.01万人（2008年末）。辖村头、金竹坑、田垄、龙船河、姜地、白石坳、三大厂、大坟脚、山田上、汤岙、清河、焦浦、泛浦、建新14个行政村。乡政府驻村头村。 【沿革】1958年设顺泰公社，1984年改乡。1997年，面积27.1平方千米，人口1万，辖建新、泛浦、清河、汤岙、堂上、村头、焦浦、大坟脚、白石坳、三大厂、姜地、龙船河、田隆、金竹坑14个行政村，乡政府驻村头村。 【邮编】325208 【2010年代码及城乡分类】330381203：～200 220建新村 ～201 220泛浦村 ～202 220清河村 ～203 220汤岙村 ～204 210堂上村 ～205 220村头村 ～206 220焦浦村 ～207 220大坟脚村 ～208 220白石坳村 ～209 220三大厂村 ～210 220金竹坑村 ～211 220田垄村 ～212 220姜地村 ～213 220龙船河村
原大南乡位于瑞安市南部。面积25.7平方千米，人口1.26万人（2008年末）。辖许峰、呈佛、杨思田、岭坪、后坪、杨角井、押头、圣井、西安、陈新、新华、中垟、下徐、中坦、蛟池、南阳、林白坑、南新18个行政村。乡政府驻许峰村。全境群山绵亘、峰峦起伏、主峰为圣井山。古迹有建于南宋年间的圣井石殿。 【沿革】1949年建大南乡，1956年南阳乡并入大南乡，1961年建公社，1984年改乡。1997年，面积28.2平方千米，人口1.3万，辖许峰、呈佛、杨角井、上思田、岭坪、后坪、押头、圣井、西安、陈新、新华、中洋、下徐、中坦、蛟池、林白坑、南阳、南新18个行政村，乡政府驻许峰村。 【邮编】325209 【2010年代码及城乡分类】330381204：～200 210许丰村 ～201 220圣井村 ～202 220押头村 ～203 220杨思田村 ～204 220长角井村 ～205 220岭坪村 ～206 220呈佛村 ～207 220陈新村 ～208 220新华村 ～209 220西安村 ～210 220后坪村 ～211 220林白坑村 ～212 220蛟池村 ～213 220南阳村 ～214 220南新村 ～215 220下徐村 ～216 220中坦村 ～217 220中垟村