1996年5月8日原属萧山市的西兴、长河、浦沿三镇划入杭州市区，由西湖区托管；12月12日，以三镇为基础成立杭州市滨江区。
1998年末，滨江区北与杭州市西湖区及上城区隔江相望，东界萧山市宁围镇，南与萧山市城厢镇、闻堰镇接壤。总面积73.3平方千米，总人口9.55万人，其中非农业人口2.53万人，共有29个行政村、3个居委会。区政府驻西兴镇。
2000年第五次人口普查，滨江区总人口115887人，其中：西兴镇28265人、长河镇42739人、浦沿镇44883人。
2000年末，全区人口9.84万人。辖3个镇，29个行政村、10个居委会。
2001年，浦沿镇撤销浦沿居民区及龙山化工厂家属委员会，新建新浦、之江社区；西兴镇撤销西兴第一、西兴第二、西兴第三、西兴第四居民区，新建西陵、水电社区；长河镇撤销长河第一、长河第二、长河第三、长河第四居民区，新建天宫、中兴社区。2001年末，滨江区辖3个镇，6个社区、29个行政村。
2003年，浦沿镇撤销联庄行政村建制，新建联庄社区。2003年11月18日，浙政函[2003]191号批复，同意杭州市滨江区行政区划调整：撤销杭州市滨江区西兴镇、长河镇、浦沿镇建制，其行政区域改由滨江区政府直辖。在此范围内调整设立若干街道办事处等事宜，由杭州市按照有关规定办理。2003年12月3日杭政函[2003]170号批复：设立滨江区西兴街道、长河街道、浦沿街道办事处，驻地、所辖区域、四至界线与原建制镇相同。2003年末，滨江区辖3个街道，7个社区、28个行政村。2004年末，滨江区辖3个街道，7个社区、28个行政村。
2005年末全区总人口13.1万人。辖3个街道：浦沿街道、西兴街道、长河街道。共有12个社区、23个行政村。西兴街道面积15.16平方千米，人口2.81万人，办事处驻官河路4号，辖3个社区、7个行政村。长河街道面积30.42平方千米，人口3.9万人，办事处驻长河路18号，辖4个社区、10个行政村。浦沿街道面积26.44平方千米，人口6.35万人，办事处驻新浦路102号，辖5个社区、6个行政村