英吉沙，系维吾尔语，意为“新城”。清《西域图志》作英噶萨尔。自古就是叶尔羌与喀什噶尔间的重镇，清代设军台于此。乾隆二十四年（1759）平定大、小和卓木叛乱后，定名英吉沙尔。
汉为疏勒国地。清乾隆三十一年（1766年）设英吉沙尔领队大臣，隶属喀什噶尔道参赞大臣。光绪九年（1883年）置英吉沙尔直隶厅，分东、西、南、北四乡，隶属喀什噶尔道。民国2年（1913年）改为英吉沙县。1929年后属喀什行政区、喀什督察专区。1949年以来属喀什专区、南疆行政区，1958年后属喀什专区、喀什地区。
1999年末，英吉沙县总人口21.34万人，其中少数民族20.97万人，农村人口16.6万人。辖1个镇、13个乡：英吉沙镇、城关乡、芒辛乡、萨罕乡、托普鲁克乡、英也尔乡、色提力乡、克孜勒乡、苏盖提乡、龙甫乡、乔勒潘乡、乌恰乡、艾古斯乡、依格孜也尔乡。
2000年第五次人口普查，英吉沙县常住总人口213338人，其中：英吉沙镇22510人、城关乡14578人、乔勒潘乡 9722人、龙甫乡6120人、芒辛乡21603人、色提力乡7790人、萨罕乡23338人、英也尔乡10654人、克孜勒乡19616人、托普鲁克乡10689人、苏盖提乡19680人、乌恰乡33406人、艾古斯乡8459人、依格孜也尔乡4156人、兵团东风农场1017人。
2003年，英吉沙县总面积3420.9平方千米，总人口229166人。辖1镇13乡：英吉沙镇、城关乡、乔勒潘乡、芒辛乡、乌恰乡、苏盖提乡、托普鲁克乡、克孜勒乡、艾古斯乡、龙甫乡、萨罕乡、英也尔乡、色提力乡、依格孜也尔乡。县政府驻英吉沙镇。
2010年第六次人口普查，英吉沙县常住总人口262067人，其中：城镇31113人，城关乡13058人，乔勒潘乡11848人，龙甫乡6882人，芒辛乡25746人，色提力乡10424人，萨罕乡30029人，英也尔乡12593人，克孜勒乡24772人，托普鲁克乡13860人，苏盖提乡23280人，乌恰乡42385人，艾古斯乡9371人，依格孜也尔乡5114人，兵团东风农场1592人。