县名得自岳普湖河名。岳普湖，据传是由突厥语“亚巴库”演变而来。亚巴库是突厥语的一个部落，11世纪时在这一带定居。
清光绪年间为疏勒府本府五大回庄之一，称岳普尔湖庄。1941年由疏勒县析置岳普湖设治局，1943年升为岳普湖县，属喀什督察专区。新中国成立后，先后属喀什专区、南疆行政区。1978年后属喀什地区。
1999年末，岳普湖县辖1镇8乡5个国营农林牧场：岳普湖镇、艾西曼乡、阿其克乡、铁热木乡、巴依阿瓦提乡、阿洪鲁库木乡、岳普湖乡、色也克乡、也克先巴扎乡。全县总人口（不包括境内生产建设兵团农三师四十二团场，下同）125192人，其中少数民族121833人，农村人口102679人。
2000年第五次人口普查，岳普湖县常住总人口129441人，其中：岳普湖镇18379人、岳普湖乡12720人、也克先拜巴扎乡16458人、艾西曼乡14053人、阿其克乡17213人、色也克乡17508人、铁热木乡17561人、巴依阿瓦提乡 9186人、阿洪鲁库木乡2392人、兵团42团3971人。
2003年，岳普湖县总面积3165.76平方千米，总人口135876人。辖2镇、7乡：岳普湖镇、艾西买镇、岳普湖乡、色也克乡、也克先拜巴扎乡、阿其克乡、铁热木乡、巴依阿瓦提乡、阿洪鲁库木乡。县政府驻岳普湖镇。
2010年第六次人口普查，岳普湖县常住总人口147688人，其中：岳普湖镇22092人，艾西曼镇14803人，岳普湖乡13461人，也克先拜巴扎乡18771人，阿其克乡21583人，色也克乡18064人，铁热木乡18971人，巴依阿瓦提乡10460人，阿洪鲁库木乡2524人，岳普湖县农场1137人，岳普湖县林场417人，岳普湖县奶牛场469人，岳普湖县良种场824人，岳普湖县大畜场486人，兵团四十二团3626人。
2014年10月20日，自治区政府（新政函[2014]179号）同意撤销铁热木乡，设立铁热木镇。调整后，全县辖3个镇、6个乡：岳普湖镇、艾西买镇、铁热木镇、岳普湖乡、也克先拜巴扎乡、阿其克乡、色也克乡、巴依阿瓦提乡、阿洪鲁库木乡。