1683年清政府时期，竹堑改属诸罗县。雍正元年(1723年)，淡水厅治设于竹堑。光绪元年（1875年），淡水厅废除，竹堑城改称新竹并设县治。
甲午战争后，日本占据台湾。将新竹划归台北县，并置新竹支厅管理。1920年9月合新竹、桃园支厅为新竹州，州治设于新竹郡（1930年新竹市自新竹郡分出，州治改新竹市）。1941年合并香山庄全部及旧港、六家庄的一部分，扩大行政区域，下设廿五个区会协助推行巿政。
1945年台湾光复，10月25日台湾行政长官公署接受日本人台湾总督的投降，11月5日公布各州接管委员会。新竹州接管委员即于8日由主任委员率领来竹，9日开始接收原新竹州的机构。同月17日接收新竹巿役所，遂成立新竹巿政府，隶属于接管委员会，11月30日将原日据时期所设二十五区改为九区，同时接收原各郡役所。翌年一月接管委员会结束，成立新竹县政府，暂借原新竹州厅办公。新竹县政府于2月28日迁往桃园，新竹巿亦因全省行政区域调整，正式设为省辖巿，成立新竹巿政府，下设东、西、南、北、竹东、宝山、香山等七个区公所，并迁入原州厅办公室。
1950年4月22日，台湾省政府公布本省地方自治实施纲要，10月25日调整全省行政区域，改设21县巿，新竹地方乃将原省辖新竹市并原新竹县辖关西、新埔两镇、湖口、红毛、竹北、横山、芎林、北埔、峨眉等七乡及尖石、五峰两山地乡等成立为新竹县。县治设于新竹巿，并将原新竹县分设桃园、苗栗两县县治分设桃园、苗栗两镇。
1945年10月台湾正式归还。国民党政府接管台湾，考虑到地方自治的需要，乃将日本统治时期的五州三厅，改为八县，并将日本统治时期的11市改为9省辖市、2县辖市。其中：新竹市管辖区域：东为新竹市东区金山面，位于东经121°1′47″；西为香山区盐水港，位于东经120°52′13″；南为香山区南隘，位于北纬24°12′39″；北为北区十块寮，位于北纬24°51′18″。其四周除西临海外，其他三面与新竹县境节邻，东与芎林、横山、北埔3乡为界，北以头前溪与竹北乡为界。面积满潮时为227.1419平方千米，人口96701人。管辖东、西、南、北、香山等5区。市政府设于新竹市北区。
1950年台湾省调整各县市行政区域，其中：原新竹县合新竹市分为桃园、新竹、苗栗三县。新竹县管辖新竹市及新竹、竹东二区，计1市（7区）14乡镇，326060人，面积1482.4654平方千米。 新竹县：辖新竹市及关西、新埔、竹东3镇，及香山、竹北、湖口、横山、新丰、芎山、宝山、北埔、峨眉、尖石、五峰等11乡。疆界：东为尖石乡雪白山，位于东经121°22′48″；西为香山乡南港，位于东经120°51′23″；南为尖石乡大霸尖山，位于北纬24°25′55″；北为新丰乡福兴，位于北纬24°56′50″。东以桃山山系与宜兰、台中两县为界，西临台湾海峡，南连苗栗县，北邻桃园县辖桃园。县政府设于新竹市。
1951年12月1日，将原东、西、南、北等四区合并成立县辖巿，新竹巿公所在地置于中正路原东区区公所，1955年夏迁入林森路原县立中学办公。
1982年6月准予自1982年7月1日起将原属新竹县的香山乡并入县辖新竹巿改制升格为省辖巿，省辖巿新竹巿政府于1982年7月1日正式成立。1985年6月24日，香山乡并入新竹市改制升格为香山区，所辖村更改为里。1990年11月1日新竹市下设东、北、香山等三个区公所，正式分区治事。
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