武清，古为泉州（是指汉朝以前近海边疆的羁糜州），昔号雍阳。汉泉州（西汉元封五年立县）、雍奴二县之地。泉州和雍奴二县均因水得名。武清县内古有“泉州渠”，故称泉州。《水经注》云：“雍奴，薮泽之名。四面有水曰雍，澄而不流曰奴。雍奴薮甚大，东极于海。”泉州县城在今黄庄街道城上村北。雍奴县城在三角淀（今王庆坨镇东9千米处）。
北魏太平真君七年（448年）省泉州县入雍奴县。雍奴县治后来迁至今泗村店镇旧县村。唐天宝元年（742年）更名武清县。明洪武初迁治于元卫帅府镇抚衙（今城关镇）。1949年后武清县曾属河北省天津地区。1950午10月迁治于杨村镇。1973年划归天津市。2000年6月13日，国务院（国函[2000]67号）批复同意撤销武清县，设立武清区，区政府驻杨村镇。
1988年，城关、崔黄口、河西务、王庆坨等乡撤乡设镇。1990年大良乡撤乡设镇。1991年梅厂乡撤乡设镇。1995年，南蔡村、泗村店、东马圈、石各庄等乡撤乡设镇。1996年大孟庄乡撤乡设镇。
1996年，武清县面积1574平方千米，人口约79万人。辖12个镇、22个乡：杨村镇、崔黄口镇、梅厂镇、大良镇、泗村店镇、大孟庄镇、河西务镇、东马圈镇、石各庄镇、王庆坨镇、城关镇、南蔡村镇、徐官屯乡、大碱厂乡、后巷乡、河北屯乡、大黄堡乡、黄庄乡、上马台乡、曹子里乡、北蔡村乡、陈咀乡、双树乡、豆张庄乡、东蒲洼乡、高村乡、大沙河乡、聂庄子乡、白古屯乡、 下朱庄乡、大王古庄乡、黄花店乡、下伍旗乡、汊沽港乡。县政府驻杨村镇。
2000年，武清区辖17个镇、17个乡：杨村镇、崔黄口镇、河西务镇、王庆坨镇、城关镇、梅厂镇、大良镇、下伍旗镇、南蔡村镇、大孟庄镇、泗村店镇、东马圈镇、石各庄镇、汊沽港镇、大碱厂镇、黄花店镇、河北屯镇、徐官屯乡、东蒲洼乡、黄庄乡、豆张庄乡、聂庄子乡、上马台镇、曹子里乡、大黄堡乡、后巷乡、双树乡、北蔡村乡、大沙河乡、高村乡、白古屯乡、下朱庄乡、陈嘴镇、大王古庄乡。
2000年第五次人口普查，武清区总人口814752人，其中：杨村镇92871人、梅厂镇18204人、大碱厂镇20108人、崔黄口镇34658人、大良镇26069人、下伍旗镇25095人、南蔡村镇24473人、大孟庄镇22911人、泗村店镇16728人、河西务镇24982人、城关镇26337人、东马圈镇15074人、黄花店镇23659人、石各庄镇21410人、王庆坨镇36270人、汉沽港镇33913人、徐官屯乡13415人、东蒲洼乡24403人、黄庄乡20839人、豆张庄乡21644人、聂庄子乡12968人、上马台乡16381人、曹子里乡22085人、大黄堡乡17290人、后巷乡19911人、河北屯乡31388人、双树乡15372人、北蔡村乡17422人、大沙河乡15701人、高村乡17756人、自古屯乡21304人、大王古庄乡20899人、陈咀乡29329人、下朱庄乡11851人、武清农场2032人。
2001年，撤销聂庄子乡，并入梅厂镇；撤销后巷乡，并入崔黄口镇；撤销双树乡，并入大良镇；撤销北蔡村乡，并入南蔡村镇；撤销大沙河乡，并入河西务镇；河北屯、大王古庄、陈咀等乡撤乡设镇。乡镇区划调整后，武清区辖6个街道（其中有农业街道6个）、19个镇、5个乡：运河东街道、运河西街道、南湖街道、北岚街道、凤河街道、泉州街道，大良镇、崔黄口镇、梅厂镇、南蔡村镇、河西务镇、河北屯镇、大减厂镇、下武旗镇、城关镇、黄花店镇、石各庄镇、王庆坨镇、汊沽港镇、东马圈镇、泗村店镇、大孟庄镇、上马台镇、大王古庄镇、陈嘴镇，白古屯乡、高村乡、豆张庄乡、曹子里乡、大黄堡乡。
2004年初，武清区辖6个街道、19个镇、5个乡：杨村街道、运河西街道、徐官屯街道、下朱庄街道、黄庄街道、东蒲洼街道，东马圈镇、黄花店镇、石各庄镇、王庆坨镇、汊沽港镇、陈嘴镇、梅厂镇、上马台镇、崔黄口镇、河北屯镇、下伍旗镇、大良镇、大碱厂镇、南蔡村镇、大孟庄镇、泗村店镇、河西务镇、城关镇、大王古庄镇，豆张庄乡、大黄堡乡、曹子里乡、高村乡、白古屯乡。
2013年，撤销豆张庄乡、曹子里乡、大黄堡乡、高村乡、白古屯乡，设立豆张庄镇、曹子里镇、大黄堡镇、高村镇、白古屯镇（津民复[2013]6号）。调整后，全区辖6个街道、24个镇：杨村街道、下朱庄街道、东蒲洼街道、黄庄街道、徐官屯街道、运河西街道、梅厂镇、大碱厂镇、崔黄口镇、大良镇、下伍旗镇、南蔡村镇、大孟庄镇、泗村店镇、河西务镇、城关镇、东马圈镇、黄花店镇、石各庄镇、王庆坨镇、汊沽港镇、河北屯镇、上马台镇、大王古庄镇、陈咀镇、豆张庄镇、曹子里镇、大黄堡镇、高村镇、白古屯镇。区政府驻运河西街道雍阳西道118号。