县境有蒲子山，“相传尧师伊蒲子隐处，汉以此山名县”。一说，似当以盛产蒲草为名。北魏于今县城西北15千米古县村置平昌县，属北吐京郡。太和二十一年（497）于今县城东南25千米黑龙关镇别置石城县，属五城郡。北周于石城县置石城郡。大象元年（579）废石城郡、县，改置蒲子县，属定阳郡，徙治今城关西8千米略东村。
隋开皇元年（581）平昌县废入蒲子县，徙治平昌县故治。大业二年（606）改蒲县，徙治今城关西南1千米，属龙泉郡。唐武德元年（618）徙治今城关。次年于县置昌州；又于今城关西别置昌原县，于今城关西南20千米别置常安县，俱属昌州。贞观元年（627）废昌州及昌原、常安2县，蒲县属隰州。
金兴定五年（1221）升蒲州。元复为蒲县，后废入隰川县。旋复置，属隰州。明属平阳府。清先后属吉州、隰州。民国初年属河东道，道废后直属省。1949年属临汾专区。1954年属晋南专区。1958年废入吕梁县。1961年复置。1967年属晋南地区。1970年属临汾地区。2000年属地级临汾市。
1996年，蒲县面积1510平方千米，人口约8万人。辖4个镇、11个乡：城关镇、克城镇、薛关镇、黑龙关镇、公峪乡、太林乡、红道乡、化乐乡、西坪垣乡、山口乡、山中乡、乔家湾乡、古县乡、曹村乡、刁口乡。县政府驻城关镇。
2000年第五次人口普查，蒲县常住总人口98860人，其中，城关镇22889人，薛关镇7509人，黑龙关镇13225人，克城镇10900人，山中乡2886人，山口乡1006人，古县乡4389人，红道乡2342人，西坪垣乡1306人，刁口乡1019人，化乐乡6517人，曹村乡3550人，乔家湾乡7385人，太林乡9074人，公峪乡4863人。
2001年，撤销刁口乡，并入城关镇，更名为蒲城镇；撤销化乐乡，并入黑龙关镇；撤销公峪乡，并入克城镇；撤销山口乡，并入山中乡；撤销西坪垣乡，并入红道乡；撤销曹村乡，并入乔家湾乡。区划调整后，全县辖4个镇、5个乡：蒲城镇、薛关镇、黑龙关镇、克城镇、山中乡、古县乡、红道乡、乔家湾乡、太林乡。县政府驻蒲城镇。
2010年第六次人口普查，蒲县常住总人口107339人，其中，蒲城镇32240人，薛关镇5175人，黑龙关镇20121人，克城镇17148人，山中乡2808人，古县乡4814人，红道乡2616人，乔家湾乡13398人，太林乡9019人。
2015年末，蒲县辖4个镇、5个乡（合计9个），2个居委会、93个村委会（合计95个）。