秦于今城关西南33千米宝井村北置汾阴县，属河东郡，十六国前赵废。北魏太和十一年（487年）复置，于县置北乡郡，县属之，徙治今宝井村。北周复归故治，改北乡郡为汾阴郡。隋开皇三年（583年）废汾阴郡，县属河东郡，仍治今宝井村。义宁年间复置汾阴郡，县属之。唐武德元年（618年）汾阴郡改泰州，二年州治徙今河津市境，三年于今城关南6.5千米古城村北置万泉县，先后属泰州、解州、绛州、蒲州。开元十一年（723年）汾阴县改宝鼎县，与万泉县俱属河中府。
宋大中祥符四年（1011年）宝鼎县改荣河县，属庆成军，兼为军治。金贞佑三年（1215年）废军，荣河县升荣州，万泉县属之。蒙古至元三年（1266年）废万泉县，十六年复置。元降荣州为荣河县，与万泉县俱属河中府。明属蒲州。清雍正六年（1728年）属蒲州府。民国初年废府，2县改属河东道，道废后直属省。1920年荣河县自宝井村徙治今城关西南25千米荣河镇。
1949年属晋南区运城分区，隶陕甘宁边区。后复归山西省，属运城专区。1954年并万泉、荣河二县，设万荣县，以二县首字命名，属晋南专区，县政府驻原万泉县解店镇。1959年撤销万荣县，并入稷山县。1960年复置万荣县。1967年属晋南地区。1970年属运城地区。2000年属地级运城市。
1997年末，全县面积1037平方千米。人口412563人。辖4个镇、13个乡：城关镇、荣河镇、汉薛镇、通化镇、南张乡、裴庄乡、光华乡、宝井乡、王显乡、贾村乡、高村乡、万泉乡、埝底乡、皇甫乡、三文乡、里望乡、西村乡。共有282个行政村，409个自然村。县政府驻城关镇。
2000年第五次人口普查，万荣县常住总人口425598人，其中，城关镇57393人，通化镇29930人，汉薛镇19528人，荣河镇32510人，万泉乡15653人，里望乡25438人，西村乡19614人，南张乡30779人，高村乡31974人，三文乡7176人，皇甫乡11755人，埝底乡11908人，贾村乡25748人，王显乡30443人，宝井乡13004人，光华乡35254人，裴庄乡27491人。
2001年乡镇区划调整后，全县辖4个镇、10个乡：解店镇、通化镇、汉薛镇、荣河镇、万泉乡、里望乡、西村乡、南张乡、高村乡、皇甫乡、贾村乡、王显乡、光华乡、裴庄乡。县政府驻解店镇。
2010年第六次人口普查，万荣县常住总人口439364人，其中，解店镇81386人，通化镇29718人，汉薛镇24910人，荣河镇42855人，万泉乡14752人，里望乡25586人，西村乡18941人，南张乡31471人，高村乡31564人，皇甫乡20697人，贾村乡25094人，王显乡28862人，光华乡36075人，裴庄乡27453人。
2015年末，万荣县辖4个镇、10个乡（合计14个），281个居委会、5个村委会（合计286个）。