系古历城的村庄田野，1948年济南解放后全市设立11个行政区。为市第五区，1954年改称第四区，1955年济南市设五个大行政区，因其地处市区中心定名为市中区。1959年市中区撤销，分属槐荫、历下两区管辖，1960年恢复市中区建制，1967年改名红旗区，1973年复称市中区。
1985年9月，面积13平方千米。设经二路、经七路、大观园、馆驿街、共青团路、岔路街、四里村、西青龙街、二七新村、魏家庄、杆石桥、七里山、六里山、玉函路14个街道办事处，171个居委会。
1996年，市中区面积61平方千米，人口约32.2万人。辖15个街道、1镇。区政府驻杆石桥街道。
2000年，将历城区的党家庄、十六里河两镇整建制划归市中区管辖；调整后市中区辖15个街道、3个镇，面积是调整前的5.3倍，人口净增10.4万人。
2000年第五次人口普查，市中区常住总人口572141人。杆石桥街道面积1.46平方千米，人口31262人人；经二路街道面积0.67平方千米，人口9677人；馆驿街街道面积0.42平方千米，人口9288人；魏家庄街道面积0.41平方千米，人口17463人；大观园街道面积0.51平方千米，人口16245人；经七路街道面积0.44平方千米，人口11849人；岔路街街道面积0.42平方千米，人口11159人；四里村街道面积3.00平方千米，人口29669人；泺源街道面积1.68平方千米，人口32105人；王官庄街道面积6.00平方千米，人口36146人；二七新村街道面积1.67平方千米，人口33422人；六里山街道面积3.50平方千米，人口39832人；七里山街道面积2.40平方千米，人口33563人；玉函路街道面积1.25平方千米，人口19309人；舜玉路街道面积3.74平方千米，人口46376人；七贤镇面积33.20平方千米，人口77932人；十六里河镇面积101.19平方千米，人口53129人；党家庄镇面积118.75平方千米，人口63715人。
2001年底，全区总面积280.25平方千米。总人口51.18万人，其中非农业人口38.81万人。辖13个街道、2个镇，92个行政村、95个居委会、44个家委会。
2002年底，全区总面积280.25平方千米。总人口52.63万人。辖13个街道、2个镇，92个行政村、95个居委会、44个家委会。
2003年底，全区总面积280.25平方千米。总人口540163人。有少数民族23个、27798人。辖13个街道、2个镇：大观园街道、杆石桥街道、四里村街道、魏家庄街道、二七街道、七里山街道、六里山街道、舜玉路街道、泺源街道、王官庄街道、舜耕街道、白马山街道、七贤街道、党家庄镇、十六里河镇。共有92个行政村、95个居委会。
2007年5月28日，经省政府批准，市中区撤销十六里河镇，以原十六里河镇的行政区域设立十六里河街道办事处和兴隆街道办事处；撤销党家庄镇，以原党家庄镇的行政区域设立党家街道办事处和陡沟街道办事处。撤镇设办后，市中区辖17个街道办事处。6月4日正式实施撤镇设办。
2010年第六次人口普查，市中区常住总人口713581人，其中，大观园街道18822人，杆石桥街道44318人，四里村街道45527人，魏家庄街道22002人，二七新村街道39006人，七里山街道44090人，六里山街道56414人，舜玉路街道69131人，泺源街道24313人，王官庄街道41558人，舜耕街道17512人，白马山街道55977人，七贤街道75636人，十六里河街道64477人，兴隆街道25248人，党家街道42514人，陡沟街道27036人。
2015年末，市中区辖17个街道，113个居委会、77个村委会（合计190个）。