仁寿在秦属武阳县。隋开皇十三年（593）改普宁名仁寿县，为陵州治。因梁为怀仁郡地，命名仁寿，寓意吉祥，又取仁义长寿之意。唐天宝元年（742）改陵州为仁寿郡。北宋熙宁五年（1072）废陵州为陵井监辖仁寿县。南宋乾道六年（1170）属隆州。明洪武六年（1373）分仁寿县复置井研县。清雍正五年（1727）县由成都府改隶属川南道资州。民国元年（1912）县属成都府，1913年改属下川南道，1914年下川南道改称永宁道，1924年废道直属四川省政府，1935改属省第二督察区。1950年属川南行政区内江专区，1958年改属乐山专区，1985年属省辖乐山市，1997年划归新成立的眉山地区管辖。现属眉山市。
1996年，仁寿县面积2606.4平方千米，人口150万人。辖21镇89乡：文林镇、大化镇、黑龙滩镇、文宫镇、富加镇、汪洋镇、钟祥镇、始建镇、彰加镇、慈航镇、龙正镇、北斗镇、禾家镇、中农镇、禄加镇、宝飞镇、满井镇、龙马镇、方加镇、清水镇、杨柳镇、建新乡、宝马乡、花瓷乡、青岗乡、三溪乡、珠嘉乡、蜂蜜乡、于丞乡、松林乡、府君乡、古佛乡、观寺乡、三峨乡、高家乡、中坝乡、鳌陵乡、千合乡、板燕乡、五福乡、花房乡、石嘴乡、藕塘乡、齐家乡、农旺乡、玉龙乡、大洪乡、涂加乡、大革乡、四公乡、永宁乡、松峰乡、大联乡、碗厂乡、青石乡、清泉乡、曹家乡、谢山乡、合兴乡、铁牛乡、骑虎乡、促进乡、铧炉乡、勤乐乡、月桥乡、正兴乡、万寿乡、光相乡、洪峰乡、古建乡、分水乡、甘泉乡、城堰乡、鸭池乡、宝石乡、谢安乡、龙凤乡、金耀乡、双堡乡、石盘乡、新店乡、马鞍乡、河口乡、板桥乡、天明乡、复合乡、凤陵乡、鹤立乡、鹤鸣乡、识经乡、白凤乡、天峨乡、双胜乡、元正乡、兆嘉乡、景贤乡、金凤乡、曲江乡、金鸡乡、元通乡、中岗乡、龙江乡、向家乡、凤梧乡、龙桥乡、钢铁乡、视高乡、兴盛乡、里仁乡、团结乡。县政府驻文林镇。
2000年第五次人口普查，仁寿县总人口1398462人，其中（23个镇、87个乡）：文林镇112740人，大化镇19977人，文官镇35657人，高家镇20136人，富加镇33450人，汪洋镇38060人，钟祥镇26220人，始建镇25681人，彰加镇20285人，慈航镇16927人，龙正镇24005人，北斗镇17988人，禾加镇26254人，中农镇15114人，禄加镇16100人，宝飞镇19498人，龙马镇25230人，方加镇29434人，清水镇26653人，钢铁镇12948人，满井镇16575人，黑龙滩镇13432人，杨柳镇23310人，于丞乡6994人，宝马乡15959人，花瓷乡9428人，青岗乡13618人，三溪乡9883人，珠嘉乡15169人，蜂蜜乡15304人，松林乡7606人，府君乡7238人，古佛乡13339人，板燕乡12767人，观寺乡12926人，三峨乡9936人，中坝乡3812人，鳌陵乡6285人，千合乡5133人，花房乡8487人，五福乡11802人，石嘴乡11758人，藕塘乡11361人，齐家乡10893人，农旺乡9813人，玉龙乡13747人，大洪乡9998人，涂加乡7059人，大革乡6950人，四公乡9053人，永宁乡7346人，松峰乡7623人，大联乡5410人，碗厂乡9976人，建新乡9070人，合兴乡9641人，清泉乡6924人，青石乡8253人，曹家乡8947人，谢山乡4404人，铁牛乡6944人，骑虎乡9480人，促进乡9667人，铧炉乡7647人，勤乐乡6974人，月桥乡7377人，正兴乡7260人，洪峰乡5117人，万寿乡4206人，古建乡5058人，宝石乡7088人，龙凤乡9538人，金耀乡6509人，甘泉乡5205人，鸭池乡7613人，谢安乡7638人，城堰乡5089人，双堡乡15561人，石盘乡7606人，新店乡8679人，马鞍乡7246人，河口乡12225人，板桥乡10583人，天峨乡8126人，识经乡7641人，凤陵乡8074人，鹤鸣乡12033人，天明乡9082人，鹤立乡8503人，复合乡10578人，白凤乡6179人，元通乡18022人，向家乡12775人，龙江乡6400人，中岗乡10707人，龙桥乡10148人，曲江乡8603人，金鸡乡7430人，凤梧乡11638人，里仁乡14977人，兴盛乡13002人，视高乡9667人，团结乡3252人，双胜乡5787人，兆加乡8409人，景贤乡10200人，金风乡4260人，元正乡7098人，光相乡9779人，分水乡6196人。
2004年，仁寿县辖文林、富加、汪洋、龙正、钟祥、钢铁、禾加、文宫、龙马、北斗、彰加、高家、满井、禄加、清水、始建、慈航、中农、宝飞、方家、杨柳、黑龙滩、大化23个镇和宝马、花瓷、大洪、建新、月桥、正兴、金耀、天峨、元通、团结、曲江、金鸡、视高、兴盛、里仁、中岗、龙江、向家、凤梧、龙桥、双胜、元正、兆嘉、景贤、金凤、虞丞、双堡、石盘、新店、马鞍、凤陵、鹤立、鹤鸣、识经、白凤、促进、铧炉、勤乐、天明、复合、甘泉、城堰、鸭池、宝石、谢安、龙凤、河口、板桥、涂家、大革、万寿、光相、洪峰、古建、分水、四公、永宁、松峰、大联、碗厂、铁牛、骑虎、松林、府君、古佛、板燕、观寺、三峨、中坝、鳌陵、千合、蜂密、三溪、珠嘉、青石、清泉、曹家、谢山、合兴、五福、花房、石嘴、藕塘、齐家、玉龙、青岗、农旺87个乡。
2005年乡镇行政区划调整后，仁寿县辖文林、富加、汪洋、龙正、钟祥、视高、禾加、文宫、龙马、北斗、彰加、高家、满井、禄加、清水、始建、慈航、中农、宝飞、方家、杨柳、黑龙滩、大化22个镇和宝马、天峨、元通、曲江、兴盛、里仁、中岗、向家、龙桥、兆嘉、景贤、虞丞、双堡、新店、凤陵、识经、促进、城堰、鸭池、谢安、河口、板桥、涂家、洪峰、四公、松峰、古佛、板燕、观寺、鳌陵、珠嘉、曹家、合兴、石嘴、藕塘、玉龙、青岗、农旺38个乡。
2010年第六次人口普查，仁寿县常住总人口1233074人，其中：文宫镇31700人，禾加镇19920人，龙马镇20027人，方加镇19357人，文林镇179603人，大化镇23737人，高家镇16673人，中农镇13326人，禄加镇25125人，宝飞镇23060人，彰加镇24774人，慈航镇23162人，汪洋镇55850人，钟祥镇31485人，始建镇29678人，满井镇24808人，富加镇40156人，龙正镇25225人，黑龙滩镇34450人，清水镇20069人，视高镇26359人，北斗镇29908人，虞丞乡5540人，青岗乡11517人，古佛乡9684人，板燕乡9205人，石咀乡11456人，藕塘乡8729人，玉龙乡14936人，合兴乡7204人，促进乡6732人，鸭池乡9037人，双堡乡14216人，河口乡12402人，板桥乡9270人，元通乡15876人，向家乡14792人，里仁乡14475人，兴盛乡13988人，兆嘉乡7487人，宝马乡20143人，珠嘉乡21055人，鳌陵乡12207人，观寺乡22763人，中岗乡15525人，龙桥乡17890人，曲江乡15716人，城堰乡8825人，谢安乡11362人，新店乡13438人，天蛾乡18957人，识经乡12106人，凤陵乡13956人，涂加乡11690人，四公乡11837人，松峰乡13276人，曹家乡17140人，景贤乡7529人，农旺乡20879人，洪峰乡11782人。
2011年，省政府批复同意撤销兴盛乡，设立兴盛镇，镇政府驻五星村老虎槽，辖原兴盛乡所属行政区域。2012年，省政府批复同意撤销观寺乡，设立观寺镇，镇政府驻南华社区南华街，辖原观寺乡所属行政区域。2013年，省政府（川府民政[2013]30号）批复同意撤销宝马乡，设立宝马镇，辖原宝马乡所属行政区域；撤销珠嘉乡，设立珠嘉镇，辖原珠嘉乡所属行政区域；撤销四公乡，设立四公镇，辖原四公乡所属行政区域。2014年，省政府（川府民政[2014]25号）批复同意撤销曹家乡、天峨乡，设立曹家镇、天峨镇。
至此，全县辖29个镇、31个乡：文宫镇、禾加镇、龙马镇、方家镇、文林镇、大化镇、高家镇、中农镇、禄加镇、宝飞镇、彰加镇、慈航镇、汪洋镇、钟祥镇、始建镇、满井镇、富加镇、龙正镇、黑龙滩镇、清水镇、视高镇、北斗镇、兴盛镇、观寺镇、宝马镇、珠嘉镇、四公镇、曹家镇、天峨镇、虞丞乡、青岗乡、古佛乡、板燕乡、石嘴乡、藕塘乡、玉龙乡、合兴乡、促进乡、鸭池乡、双堡乡、河口乡、板桥乡、元通乡、向家乡、里仁乡、兆嘉乡、鳌陵乡、中岗乡、龙桥乡、曲江乡、城堰乡、谢安乡、新店乡、识经乡、凤陵乡、涂家乡、松峰乡、景贤乡、农旺乡、洪峰乡。