秦置新都县，隋改置新乐县，唐复置新都县。1960年并入新繁县，1962年恢复新都县。1965年新繁县撤销并入新都县。2001年11月15日，国务院批准，撤销新都县，设立成都市新都区，区政府驻新都镇。2002年1月1日，正式设立成都市新都区。
1952年4月，撤销成都县，划三河乡入新都县。同时将成都县的崇义乡、复兴乡划归新繁县。1953年6月，以清白江为界，划新都264亩入彭县三邑乡，48亩入彭县竹瓦乡，彭县划85亩入新都军屯乡。1954年8月，划原华阳仁和（今石板滩镇）、同兴（今木兰乡部分地区）两个乡入新都县。
1958年3月，划华严乡入金堂县。1960年2月，划弥牟乡入成都市的青白江区，同时撤销新都县，并入新繁县。1962年10月，复置新都县，将并入原新繁县的区域划归新都县。1965年7月，撤销原新繁县，将新繁所有行政区域全部并入新都县。
1993年，新都县辖13个镇、4个乡，303个行政村，2625个农业生产合作社，以及2个国有农场、1个林场。
1996年，新都县面积482平方千米，人口约57.2万人。辖13镇4乡：新都镇、龙虎镇、三河镇、斑竹园镇、新民镇、利济镇、清流镇、泰兴镇、马家镇、新繁镇、石板滩镇、大丰镇、龙桥镇、竹友乡、军屯乡、木兰乡、龙安乡。县政府驻新都镇。
2000年第五次人口普查，新都县常住总人口611986人，其中：新都镇169834人、大丰镇31053人、石板滩镇30786人、新繁镇58187人、新民镇35861人、三河镇29577人、泰兴镇28763人、利济镇23843人、斑竹园镇29756人、清流镇16957人、龙虎镇20139人、马家镇23869人、龙桥镇23364人、龙安乡21512人、木兰乡34019人、竹友乡16195人、军屯乡18271人。
2004年4月13日，省政府（川府民政[2004]8号）批复同意新都区龙安镇政府驻地由严家桥福田院迁至安全村3社新犀路。9月8日，省政府（川府民政[2004]37号）批复同意新都区撤销大丰、三河、龙虎、龙安、利济、竹友6个镇。原大丰、三河2个镇所属行政区域实行街道办事处管理体制。将原龙虎镇所属行政区域并入新都镇；新都镇政府驻紫瑞街。将原龙安镇及原利济镇的公义、锦水、曲水、通联、石云、广济、新庞、宁河8个村所属行政区域并入新繁镇；新繁镇政府驻繁清路。将原利济镇的同义、同福、水梨、迎祥、双利、界牌、永明、柳泉、顺河、圆通10个村所属行政区域并入清流镇；清流镇政府驻清流场南街。将原竹友镇所属行政区域并入斑竹园镇；斑竹园镇政府驻复兴街。
2004年，新都区总面积481平方千米，人口密度1266人/平方千米。辖2个街道（大丰、三河）、11个镇（新都、新繁、新民、清流、龙桥、马家、泰兴、木兰、军屯、石板滩、斑竹园），43个社区、298个行政村。
2005年5月10日，省政府（川府民政[2005]18号）批复同意将青白江区龙王镇的新谊、双柏、黄果、园林、石桩、长林6个村和龙泉驿区黄土镇的回龙村、金三角社区所属的行政区域划归新都区石板滩镇管辖。石板滩镇政府驻石板滩场镇东风西街66号。7月6日，省政府（川府民政[2005]21号）批复同意将斑竹园镇的回南、檀木2村和龙桥镇的瑞云、笔架2村所属行政区域划归新繁镇管辖。
2006年，新都区辖2个街道、11个镇：大丰街道、三河街道、新都镇、石板滩镇、新繁镇、新民镇、泰兴镇、斑竹园镇、清流镇、马家镇、龙桥镇、木兰镇、军屯镇。
2007年5月，成都市政府同意新都区增设石板滩、斑竹园、龙桥、泰兴、新民、木兰、军屯、清流、马家9个街道办事处，分别与石板滩、斑竹园、龙桥、泰兴、新民、木兰、军屯、清流、马家镇政府合署办公，实行“两块牌子、一套人员”的管理模式，所辖区域和驻地与镇相同。
2010年第六次人口普查，新都区常住总人口775703人，其中：大丰街道73397人，三河街道41297人，新都镇241541人，石板滩镇48927人，新繁镇103658人，新民镇35146人，泰兴镇30814人，斑竹园镇57380人，清流镇29763人，马家镇24623人，龙桥镇31619人，木兰镇39106人，军屯镇18432人。
2013年，省政府（川府民政[2013]10号）批复同意撤销新都镇，设立新都街道。调整后，全区辖3个街道、11个镇。