巴尔虎，系蒙古族喀尔喀部落之一部名。由于巴尔虎蒙古人迁至呼伦贝尔的时间不同，故称先来为陈巴尔虎，后来者为新巴尔虎。清代归呼伦贝尔副都统衙门辖。雍正十年（1732年）组建索伦左、右两翼共分八旗，其中左翼大部驻牧在今陈旗境内，1919年成立陈巴尔虎旗。
1996年?，陈巴尔虎旗面积21192平方千米，人口5.6万人，其中蒙古族占43%。辖2镇8苏木：巴彦库仁镇、宝日希勒镇、哈尔干图苏木、巴彦哈达苏木、呼和诺尔苏木、鄂温克民族苏木、东乌珠尔苏木、西乌珠尔苏木、特尼河苏木、哈达图苏木。旗政府驻巴彦库仁镇。
2000年第五次人口普查，陈巴尔虎旗总人口67882人，其中：巴彦库仁镇22632人，宝日希勒镇19473人，完工镇4079人，西乌珠尔苏木1647人，东乌珠尔苏木1998人，哈尔干图苏木1208人，巴彦哈达苏木1893人，鄂温克民族苏木5516人，哈达图苏木4647人，特泥河苏木4789人。
2000年，陈巴尔虎旗辖3个镇、7个苏木。总人口54594人，其中少数民族27868人。
2001年，全旗辖3个镇、5个苏木：巴彦库仁镇、宝日希勒镇、完工镇、西乌珠尔苏木、东乌珠尔苏木、巴彦哈达苏木、鄂温克民族苏木、特泥河苏木。
2006年，撤销巴彦哈达苏木，并入巴彦库仁镇；撤销东乌珠尔苏木、西乌珠尔苏木，合并设立乌珠尔苏木；撤销特尼河苏木，并入宝日希勒镇；完工镇更名为呼和诺尔镇。2006年末，全旗总面积1.86万平方千米。总人口59351人；有少数民族31270人，其中蒙古族25903人。
2009年末，全旗总面积1.86万平方千米。总人口64723人，其中，非农业人口10922人；少数民族人口34088人。辖3个镇、2个苏木（其中1个民族苏木）：巴彦库仁镇、宝日希勒镇、呼和诺尔镇、乌珠尔苏木、鄂温克民族苏木。
2011年，恢复巴彦哈达苏木；撤销乌珠尔苏木，恢复东乌珠尔苏木、西乌珠尔苏木。调整后，全旗辖3个镇、4个苏木（其中1个民族苏木）：巴彦库仁镇、宝日希勒镇、呼和诺尔镇、西乌珠尔苏木、鄂温克民族苏木、东乌珠尔苏木、巴彦哈达苏木。