明为察哈尔部牧地。清乾隆二十六年（1761年）并商都马群、翁贡羊群建镶黄旗。1938年分置商都旗、明安旗。1960年化德县并入，复改镶黄旗。1963年化德县划出，旗名未改。
1996年?，镶黄旗面积4960平方千米，人口2.7万人，其中蒙古族1.7万人。辖1个镇、9个苏木：新宝拉格镇、翁贡淖尔苏木、宝格达音高勒苏木、翁贡乌拉苏木、呼格吉勒图苏木、新宝拉格苏木、那仁乌拉苏木、哈音海尔瓦苏木、巴彦塔拉苏木、洪格尔乌拉苏。旗政府驻新宝拉格镇。
2000年第五次人口普查，镶黄旗总人口26843人，其中：新宝拉格镇11830人，新宝拉格苏木1693人，宝格达音高勒苏木1868人，翁贡乌拉苏木1611人，翁贡淖尔苏木1353人，哈音海尔瓦苏木1328人，洪格尔乌拉苏木1656人，巴彦塔拉苏木2283人，呼格吉勒图苏木1261人，那仁乌拉苏木1960人。
2000年，全旗总面积4960平方千米。总人口8647户27903人，其中蒙古族17320人，汉族10484人，其他少数民族99人。辖1个镇、9个苏木，60个嘎查、6个居民区。
2001年行政区划调整后，全旗辖1个镇、3个苏木：新宝拉格镇、宝格达音高勒苏木、翁贡乌拉苏木、巴彦塔拉苏木。共有60个嘎查、6个居委会。全旗总人口27641人，其中蒙古族17584人，汉族9943人，其他少数民族114人。
2006年，镶黄旗将原有的4个苏木镇调整为2个镇、1个苏木，即新宝拉格镇、巴彦塔拉镇和翁贡乌拉苏木。共有60个嘎查、6个居民区。全旗总面积5143平方千米。总人口29720人，其中蒙古族18233人，汉族11356人，满族58人，回族36人，达斡尔族14人，其它少数民族23人。
2009年，全旗总面积5143平方千米。总人口30792人，其中蒙古族18815人，汉族11837人，其他少数民族140人。辖2个镇、1个苏木，60个嘎查、6个居民区。
2012年，恢复宝格达音髙勒苏木。调整后，全旗辖2个镇、2个苏木：新宝拉格镇、巴彦塔拉镇、翁贡乌拉苏木、宝格达音髙勒苏木。