太仆寺系蒙古族古代养马官名。汉为匈奴地。元属兴和路宝昌州。明属蒙古察哈尔部牧地。清置太仆寺左翼牧场。1918年由正白旗东部及左翼牧场各一部置宝昌招垦设治局，1925年改置宝昌县，属察哈尔省。1937年左翼牧场改置太仆寺左旗，属察哈尔盟。“旗县并存，蒙汉分治”。1956年宝昌县与太仆寺左旗合并设太仆寺旗。
1996年?，太仆寺旗面积3415平方千米，人口21.2万人，其中蒙古族占2%。辖1个镇、1个苏木、16个乡：宝昌镇、贡宝拉格苏木、红旗乡、沙沟乡、万寿滩乡、头支箭乡、永丰乡、中河乡、红山子乡、五面井乡、骆驼山乡、城郊乡、千斤沟乡、马坊子乡、兴盛乡、小营盘乡、幸福乡、东井子乡。旗政府驻宝昌镇。
2000年第五次人口普查，太仆寺旗总人口170261人，其中：宝昌镇31655人，幸福乡6403人，东井子乡4784人，五面井乡8869人，红山子乡10561人，红旗乡7885人，沙沟乡6713人，万寿滩乡8087人，头支箭乡7816人，中河乡7592人，骆驼山乡11217人，千斤沟乡15269人，永丰乡9760人，城郊乡10222人，马坊子乡9116人，兴盛乡8993人，小营盘乡1614人，贡宝拉格苏木3072人，万寿滩良种场633人。
2000年，全旗面积3414.74平方千米。总人口207986人，其中汉族195790人，蒙古族5205人，满族6383人，回族529人。辖1个镇、1个苏木、16个乡，174个村（嘎查）、14个居委会，516个自然村（浩特），648个村民小组。
2001年行政区划调整后，全旗辖4个镇、7个乡、1个苏木：宝昌镇、千斤沟镇、永丰镇、头支箭镇、幸福乡、五面井乡、红旗乡、沙沟乡、中河乡、骆驼山乡、兴盛乡、贡宝拉格苏木。
2006年，太旗将原有的12个苏木乡镇调整为6个，即宝昌镇、千斤沟镇、红旗镇、骆驼山镇和贡宝拉格苏木及幸福乡。
2006年，全旗总面积3415平方千米。总人口20.3万人，其中农业人口16.4万人，非农业人口3.9万人。辖4个镇、1个苏木、1个乡，176个行政村（其中19个嘎查）和14个居委会。
2009年，全旗总面积3415平方千米。总人口20.3万人，其中农业人口16.4万人，非农业人口3.9万人。辖4个镇、1个苏木、1个乡，176个行政村（其中19个嘎查）和8个居委会。
2012年，恢复永丰镇。调整后，全旗辖5个镇、1个乡、1个苏木：宝昌镇、千斤沟镇、红旗镇、骆驼山镇、永丰镇、幸福乡、贡宝拉格苏木。