昆都仑区因境域跨昆都仑河得名。“昆都仑”系蒙古语译音，意为“横”。1949年前后属包头县、乌拉特前旗。1956年设昆都仑区。
1996年?，昆都仑区面积75.5平方千米，人口36.1万，其中蒙古族占3.3%，辖11个街道：阿尔丁大街街道、张家营子街道、少先路街道、白云鄂博路街道、鞍山道街道、前进道街道、阿吉拉街道、友谊大街街道、团结大街街道、沼潭街道、林荫路街道。
2000年第五次人口普查，昆都仑区总人口505951人，其中：少先路街道57826人，张家营子街道11604人，沼潭街道34098人，林荫路街道25446人，友谊大街街道30217人，阿尔丁大街街道38450人，团结大街街道39132人，鞍山道街道32937人，前进道街道36567人，市府东路街道20831人，白云鄂博路街道28548人，黄河西路街道33195人，昆工路街道31507人，昆河镇73964人，包钢集团公司厂区11629人。
2000年，昆都仑区面积94.8平方千米。人口50万人。辖13个街道、1个镇，177个居委会、4个村委会。
2006年，全区面积95平方千米，人口57万人。
2008年，将九原区的部分行政区域划归昆都仑区管辖。
2009年，全区面积301平方千米，人口64.3万人。辖14个街道、3个镇。
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