1984年5月31日，桃源公社分设桃源乡、张坊乡；相山公社分设相山乡、山斜乡、港下乡（赣府厅字[1984]166号）。1985年3月15日，撤销相山乡，设置相山镇（赣府厅字[1985]160号）。
1993年1月3日，撤销航埠乡、礼被乡、孙坊乡、河上乡，设立航埠镇、礼被镇、孙坊镇、河上镇（赣民字[1993]1号批复）。
1997年，全县面积1520平方千米，人口29.2万。辖6个镇、15个乡：巴山镇、河上镇、孙坊镇、航埠镇、礼陂镇、相山镇、白路乡、东来乡、三山乡、六家桥乡、白陂乡、郊西乡、沙堤乡、马鞍乡、石庄乡、郭圩乡、许坊乡、桃源乡、张坊乡、港下乡、山斜乡。县政府驻巴山镇。
2000年第五次人口普查，全县总人口298734人；其中：巴山镇58827人、相山镇7827人、航埠镇21184人、孙坊镇18999人、河上镇17615人、礼陂镇13362人、石庄乡9124人、郊西乡7557人、沙堤乡20849人、六家桥乡14948人、白路乡13980人、东来乡7036人、三山乡11433人、马安乡15533人、白陂乡9041人、山斜乡9238人、港下乡3788人、桃源乡9398人、张坊乡5128人、许坊乡10682人、郭圩乡13185人。
2001年3月2日，撤销马鞍乡，设立马鞍镇（赣民字[2001]94号批复）。2001年9月6日，撤销沙堤乡、郊西乡，划归巴山镇；撤销山斜乡、港下乡，划归相山镇；撤销东来乡，划归河上镇；撤销张坊乡，划归桃源乡管辖（赣民字[2001]441号批复）。
2002年底，崇仁县面积1520平方千米，人口31.0万人，其中非农业人口4.1万人。辖7个镇、8个乡，189个居委会、163个行政村。县政府驻巴山镇。
2003年底，全县辖7镇8乡，总人口31.6万人。
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