春秋为吴地，战国属楚，秦属九江郡。汉高祖六年（公元前201年）始置彭泽县，因县西有彭蠡泽而得名，县治在今湖口县境之小凰山下（即今文桥至江桥之间，早废），属豫章郡。季汉入吴，属彭泽郡，后属武昌郡，晋属浔阳郡，又属江州。南朝梁属太原郡，隋开皇九年（公元589年）改彭泽为龙城县，属江州，开皇十八年（598年）复名彭泽，属九江郡。
唐武德五年（622年）置浩州，彭泽为附郭县，迁县治于今黄岭乡旧县街，并割彭泽之西为都昌。武德八年属江州。五代为南唐地，属江州，升元二年（938年）割彭泽乡及五柳乡之半为湖口，又割黄菊乡入皖之东流，迁县治于今址。宋、元属江州，明、清属九江府。解放前夕属浮梁专署。1949年4月解放时属赣东北鄱阳专区，同年7月属九江专区。1983年属九江市。
1992年5月6日，撤销马垱乡，设立马垱镇（赣民字[1992]74号批复）。1993年1月3日，撤销棉船乡、芙蓉乡、定山乡、天红乡、杨梓乡、东升乡、瀼溪乡，设立棉船镇、芙蓉镇、定山镇、天红镇、杨梓镇、东升镇、瀼溪镇（赣民字[1993]3号批复）。1995年3月10日，撤销泉山乡，设立泉山镇（赣民字[1995]35号批复）。
1996年，全县辖10个镇、9个乡：龙城镇、棉船镇、马垱镇、泉山镇、瀼溪镇、芙蓉墩镇、东升镇、定山镇、天红镇、杨梓镇、和团乡、海形乡、太泊湖乡、浩山乡、黄花乡、黄岭乡、湖西乡、太平关乡、乐观乡。县政府驻龙城镇。
2000年第五次人口普查，彭泽县常住总人口331085人，其中，龙城镇41865人、棉船镇35616人、马当镇25191人、泉山镇20004人、芙蓉墩镇20815人、定山镇17634人、天红镇14121人、杨梓镇20127人、东升镇15773人、瀼溪镇11965人、潮西乡9433人、太平关乡18632人、乐观乡10018人、浩山乡9180人、和团乡6362人、黄花乡17252人、黄蛉乡16448人、太泊湖乡5444人、海形乡3685人、美蓉农场11520人。
2001年12月25日，撤销海形乡，划归浩山乡；撤销乐观乡，划归杨梓镇；撤销和团乡，划归马垱镇；撤销湖西乡，划归芙蓉墩镇；撤销泉山镇，划归龙城镇；撤销太泊湖乡，划归黄花乡（赣民字[2001]601号批复）。
2002年7月16日，撤销黄花乡，设立黄花镇（赣民字[2002]155号批复）。2002年末，全县辖10个镇、3个乡，10个居委会、175个行政村。2003年末，全县总人口34.7万人。
2010年第六次人口普查，彭泽县常住总人口353149人，其中，龙城镇65736人，棉船镇35852人，马垱镇33978人，芙蓉墩镇32575人，定山镇15504人，天红镇15974人，杨梓镇29493人，东升镇14070人，瀼溪镇12930人，黄花镇18078人，太平关乡20612人，黄岭乡16916人，浩山乡12975人，太泊湖农业综合开发区5503人，上十岭综合垦殖场3523人，芙蓉农场11108人，建筑材料厂2898人，县水产养殖场793人，棉科所1005人，棉花原种场2356人，太泊湖水产养殖场582人，黄乐林场688人。