1949年始建城南区，1950年改为一区，1955年复称城南区，1960年改雁峰公社，1980年恢复城南区。
1996年，城南区面积17平方千米，人口约18万人。辖5个街道：先锋街道、西站街道、白沙洲街道、黄茶岭街道、雁峰街道。区政府驻龙船巷。
2000年第五次人口普查，城南区常住总人口195001人，其中，先锋街道20424人、雁峰街道40484人、西站街道55499人、黄茶岭街道45814人、白沙洲街道32780人；此外，郊区的岳屏乡17871人、湘江乡30736人。
2001年4月4日，国务院批准（国函[2001]34号）：撤销衡阳市江东区、城南区、城北区、郊区，设立衡阳市珠晖区、雁峰区、石鼓区、蒸湘区。雁峰区辖原城南区的雁峰、白沙洲、黄茶岭、天马山、先锋路5个街道和原郊区的湘江乡（不含杨柳村）、岳屏乡（不含联合、岳屏、北塘3个村）以及衡南县的文昌乡。区人民政府驻湘江南路。
2004年，雁峰区辖5个街道、1个镇、1个乡：先锋街道、雁峰街道、天马山街道、黄茶岭街道、白沙洲街道、岳屏镇、湘江乡。 先锋街道辖沿江南路、中山南路、光辉、左家台、爱民路、先锋、黄青巷7个社区。 雁峰街道辖打线坪、接龙村、余德塘、雨花亭、巷荫岭、雁峰路、厉家冲、新家村、当家村9个社区和岳东村委会。 天马山街道辖岳屏、洪家塘、苏眼井、胜利山、天马山、荣誉路口6个社区。 黄茶岭街道辖黄茶岭、珠江桥、茶叶塘、营盘村、衡常村、黄茶路、小塘村、雷公塘、丁家牌楼9个社区和红旗村委会。 白沙洲街道辖新矿村、铜桥港、园林、欧水岭、纺织新村、联盟山、白沙洲、白竹皂、塑田村、金龙村10个社区。 岳屏镇辖三〇一、芝麻塘2个居委会和文昌、斯林、山田寺、复龙、公益、东风、水东、前进、金桥、兴隆、隆桥11个村委会和岳屏农场、跃进农场。 湘江乡辖东洲、湘江、五星、高兴、茶园、奇峰、茅叶、长塘、白沙9个村委会。 湘江农场辖农业村委会。（根据《湖南省县及县以下行政区划代码2004年》整理）
2006年，湘江农场隶属关系由雁峰区政府管理调整为隶属白沙洲工业园区管委会管理，湘江农场农业村随农场一并划转。
2010年，雁峰区将白沙洲街道的金龙村，湘江乡的长塘村、茅叶村、茶园村，岳屏镇的金桥村成建制划归金龙坪街道管辖。行政区划调整后：金龙坪街道辖4个社区、6个行政村，总面积21.99平方千米，总人口1.26万人，办事处机关驻地不变；白沙洲街道辖11个社区、1个行政村，总面积7.66平方千米，总人口4.11万人，办事处机关驻地不变；岳屏镇辖3个社区、10个行政村，总面积33.43平方千米，总人口1.87万人，镇政府驻地不变；湘江乡辖2个社区、6个行政村，总面积16.86平方千米，总人口1.2万人，乡政府驻地不变。
2010年第六次人口普查，雁峰区常住总人口212914人，其中，先锋街道28037人，雁峰街道40330人，天马山街道21890人，黄茶岭街道35899人，白沙洲街道39918人，岳屏镇21088人，湘江乡16769人，白沙洲工业园8983人。
2015年，天马山街道更名为天马街道（衡民函[2015]3号）。11月18日，省民政厅（湘民行发[2015]30号）批复同意：湘江乡、黄茶岭街道合并设立黄茶岭街道。衡阳市雁峰区人民政府迁址应按法定程序报国务院批准。调整后，全区辖6个街道、1个镇：先锋街道、雁峰街道、天马街道、黄茶岭街道、白沙洲街道、金龙坪街道（白沙洲工业园）、岳屏镇。