宝清县，以境内东部宝清河得名。宝清河，一说系满语“宝其赫”的转音，原意为“丑”；一说满语“猴子”的意思。清初属宁古塔副都统管辖，1732年（清雍正十年）划归三姓副都统管辖。清末，1906年（清光绪三十二年），划归临江州（后改临江府）管辖。1909年6月2日（清宣统元年四月十五日），吉林巡抚奏准，于宝清河西设置宝清州（拟从缓设置）。中华民国成立后，1912年临江府于宝清设置分防经历，1914年改为分治员。
1916年4月15日，奉令将宝清分治地方“改设县治”，名为宝清县，隶属依兰道。县境东西宽120千米，南北长100千米。1929年2月，撤销道制，改由吉林省直辖。东北沦陷后，初隶吉林省，1934年12月划归三江省管辖。1938年将饶河县七里沁河以西地区划归宝清县管辖。1939年6月，划归新设之东安省管辖。1943年后，先后隶属东满总省和东满省管辖。1945年“九三”抗日战争胜利后，划归合江省管辖。
（1946年7月2日建立宝清县民主政府）1947年8月，划归牡丹江省管辖。1948年7月，撤销牡丹江省，复归合江省管辖。1949年5月，撤销合江省，划归松江省管辖。1954年8月，松、黑两省合并后，划归黑龙江省合江专区管辖。1983年10月，将西南部的宏伟、岚峰两个公社划归七台河市管辖。1985年1月1日，正式撤销合江地区，划归佳木斯市领导。1991年4月1日，由佳木斯市划归双鸭山市领导（2月2日国务院国函[1991]4号批准）。
1992年末，宝清县位于黑龙江省东部，完达山北麓。东、南以七里沁河、完达山脊与饶河县、虎林县、密山市和七台河市分界，西与勃利县、桦南县和双鸭山市接壤，北以七星河与友谊县、富锦市毗邻。全县总面积10001.2平方千米。总人口40.6万人，其中非农业人口13.3万人，占32.76%；满、朝鲜、蒙古、回等少数民族人口2.7万人，占6.7%。辖17个乡镇。县政府驻地宝清镇。（以上摘自《黑龙江省志·地名录》，有改动）
1996年，宝清县面积1.1万平方千米，人口40.5万人。辖3个镇、14个乡：宝清镇、七星泡镇、青原镇、夹信子乡、十八里乡、凉水乡、建平乡、万金山乡、尖山子乡、宝山乡、朝阳乡、七星河乡、东升乡、富山乡、小城子乡、龙头乡、东兴乡。县政府驻宝清镇。
2000年第五次人口普查，宝清县（辖4个镇、13个乡）总人口399083人，其中：宝清镇76852人，七星泡镇39011人，青原镇23918人，夹信子镇21065人，万金山乡17798人，尖山子乡10162人，朝阳乡11635人，龙头乡11831人，小城子乡11670人，十八里乡12869人，凉水乡14069人，七星河乡8444人，富山乡4744人，东兴乡4641人，东升乡5171人，建平乡3370人，宝山乡4469人，五九七农场28959人，八五二农场49868人，八五三农场38537人。
全县现辖6个镇、4个乡：宝清镇、七星泡镇、青原镇、夹信子镇、龙头镇、小城子镇、朝阳乡、万金山乡、尖山子乡、七星河乡。