建华区，原称北关区，后以建华机械厂更名建华区。其地原名“卜奎”（卜魁）。1685年（清康熙二十四年），黑龙江将军设置茂兴（今肇源县茂兴镇）至黑龙江城（今黑河市爱辉镇）驿站，于此设卜奎站。1692年（康熙三十一年），于卜奎修筑齐齐哈尔城，别名“卜奎”。
1946年5月，齐齐哈尔市政府将全市原伪满时期的11个区调整划分为6个区，今建华区城区分属一区、五区。1954年12月11日，黑龙江省人民政府批准，以原一区北部和五区的一部分及四区的四合村合并，设立北关区。1958年12月，全市实现“人民公社化”，将原6个区改建为铁锋、龙沙、建华等10个人民公社。1961年8月30日，将11个城市公社调整为7个区，将建华公社改为建华区。
1992年末，建华区位于齐齐哈尔市境中部，嫩江东岸。北与富裕县为邻，东与铁锋区接壤，南与龙沙区毗连。全区总面积81平方千米，其中建成区面积21平方千米。总人口20.4万人，其中非农业人口19.1万人；满、回、蒙古等少数民族人口约占6%。辖东市场、东五、中华、西大桥、卜奎、建设、文化等7个街道和建华乡。区政府驻地卜奎大街北端东侧。（以上摘自《黑龙江省志·地名录》，有改动）
1996年，建华区辖7个街道、1个乡：东五街道、中华街街道、东市场街道、建设街道、卜奎街道、文化街道、西大桥街道、建华乡。
2000年第五次人口普查，全区总人口236028人，其中：西大桥街道21476人，文化街道73978人，东五街道30537人，东市场街道27178人，卜奎街道19935人，中华街道20417人，建设街道23745人，建华乡18762人。
2005年7月7日，撤销建华乡并入城市街道办事处（黑民区[2005]80号）。全区现辖5个街道：中华街道、西大桥街道、卜奎街道、建设街道、文化街道。