1995年12月23日，国务院批准撤销黄冈地区和县级黄州市，设立地级黄冈市。原黄州市分设黄州区、团风县。团风县辖原黄州市的团风、方高坪、淋山河、马曹庙、上巴河、回龙山、总路嘴、但店8个镇和王家坊、溢流河、磙子河、杜皮、贾庙5个乡，县政府驻团风镇。1996年5月正式实施。
1996年，团风县面积838.4平方千米，人口约36.3万人。辖8个镇、5个乡：团风镇、淋山河镇、总路嘴镇、但店镇、上巴河镇、马曹庙镇、回龙山镇、方高坪镇、磙子河乡、杜皮乡、贾庙乡、溢流河乡、王家坊乡。
2000年第五次人口普查，团风县常住总人口375931人，其中：团风镇68039人，淋山河镇39934人，方高坪镇27599人，迥龙山镇33324人，马曹庙镇23412人，上巴河镇33217人，总路嘴镇25976人，但店镇25912人，溢流河乡21457人，贾庙乡21870人，杜皮乡20157人，磙子河乡20967人，王家坊乡12411人，黄州监狱1656人。
2000年，撤销王家坊乡，并入团风镇；撤销磙子河乡，并入淋山河镇；撤销溢流河乡，并入但店镇。调整后，全县辖8个镇、2个乡。
2004年末，团风县总人口38.01万人，辖团风、方高坪、淋山河、回龙山、马曹庙、上巴河、总路咀、但店8个镇和贾庙、才坡2个乡，共有7个居委会、286个村委会。2005年末，团风县辖8个镇、2个乡，7个居委会、284个村委会。
2010年第六次人口普查，团风县常住总人口338609人，其中：团风镇71185人，淋山河镇57183人，方高坪镇22811人，回龙山镇32134人，马曹庙镇19640人，上巴河镇29827人，总路咀镇24063人，但店镇41226人，贾庙乡19117人，杜皮乡18816人，黄湖农场1137人，金锣港农场1470人。
2014年，团风镇、回龙山镇被列为全国重点镇。