今石龙区境区大部分（除军营行政村，以下简称境区），历史上长期属汝州管辖，有些时期归宝丰县管辖。秦朝属三川郡梁县。汉、晋属梁县，归河南郡。南北朝时，梁县先后改为汝原县、治城县。隋大业二年（606年）改治城县为承休县，归汝州。唐贞观初改承休县为梁县。宋、金、元时期，境区仍归梁县。
明成化十一年（1475年），境区由汝州划出归宝丰县，属永宁乡。清中期，境区又归汝州，属丁屯里。民国二十四年十二月，政府进行插花地划分，境区随大营镇划归宝丰县商酒务区（第三区）。1947年10月，境区划入鲁山县瓦屋区。1947年10月29日，境区解放，属宝丰县第二区。1957年撤区并乡，境区属大营中心乡。1958年属上游公社。1959年属大营公社。
1960年1月7日，国务院第93次会议决定，撤销宝丰县建制，境区划归平顶山市。1960年5月31日，市人委第16次扩大会议决定撤销大营公社，境区属韩庄矿区城市人民公社。1961年10月5日，国务院第113次会议通过恢复宝丰县建制，境区复归宝丰县，属西大营区。1961年12月28日，经省人民委员会批准，将宝丰县的韩庄、南顾庄两个公社所辖12个大队划归平顶山市管辖。
1971年5月，境区成立西区，归属平顶山市管辖。 1973年3月，撤销西区，“五七”公社归平顶山市郊区管辖，境区4个街道合并为韩梁街道，归平顶山市新华区管辖。1977年恢复西区建制。1979年4月再次撤销西区，“五七”公社仍归郊区，韩梁街道仍归新华区。1982年12月西区建制重新恢复。
1997年12月18日，国务院批复（国函[1997]111号）设立平顶山市石龙区。石龙区因境内石龙河而得名，辖原西区地域，下设南顾庄乡和梁洼、高庄2个街道，区政府驻人民路。
2000年第五次人口普查，石龙区总人口53499人，其中：高庄街道10964人、龙兴街道12906人、南顾庄乡29629人。
2005年，石龙区乡镇区划调整：撤销南顾庄乡，设立相应街道。2005年末，石龙区辖4个街道：高庄街道、龙兴街道、人民路街道（新增）、龙河街道（新增）。