因都匀河为名。一说因城东二里都云洞得名。明代平羌将军何福镇压苗族农民起义之后，于明洪武二年(1390年)奏清朝廷，以“云之为物，变化不一”为由，改“云”为“匀”，“取均匀为义”。
宋大观二年（1108）置都定云安抚司。元初置都云军民府。明初置都匀安抚司，后改都匀卫，弘治十年（1497）置都匀府。清康熙十一年（1672）设都匀县。1958年撤销都匀县，改设都匀市。1962年撤销都匀市，恢复都匀县。1966年复设都匀市。
1996年，都匀市面积2278.6平方千米，人口43万人，辖3个街道、12个镇、5个乡、3个民族乡：新华路街道、广惠路街道、文峰路街道、沙包堡镇、洛帮镇、杨柳街镇、坝固镇、大坪镇、王司镇、墨冲镇、平浪镇、凯口镇、江洲镇、小围寨镇、甘塘镇、良亩乡、河阳乡、沙寨乡、石龙乡、摆忙乡、奉合水族乡、阳和水族乡、基场木族乡。市政府驻新华路街道内。
2000年第五次人口普查，都匀市总人口463426人，其中：广惠街道32788人，文峰街道48157人，新华街道32427人，小围寨镇55299人，沙包堡镇29596人，杨柳街镇11510人，甘塘镇22476人，洛邦镇14659人，坝固镇23028人，大坪镇22851人，王司镇21005人，墨冲镇19943人，平浪镇12038人，凯口镇12489人，江洲镇11387人，奉合水族乡6916人，阳和水族乡11951人，基场水族乡11570人，良亩乡12611人，河阳乡16398人，沙寨乡16690人，石龙乡9489人，摆忙乡8148人。
2002年3月20日，贵州省政府批准同意撤销都匀市沙包堡镇和小围寨镇、并由黔南州按规定办理相关街道办事处的设立。
2003年末，都匀市辖10个镇、8个乡（其中3个民族乡）、5个街道，262个村委会、48个居委会。总人口48.75万人，其中少数民族31.94万人，非农业人口16.96万人。
2006年，都匀市辖5个街道、10个镇、5个乡、3个民族乡：广惠路街道、文峰路街道、新华路街道、小围寨街道、沙包堡街道、杨柳街镇、甘塘镇、洛帮镇、坝固镇、大坪镇、王司镇、墨冲镇、平浪镇、凯口镇、江洲镇、奉合水族乡、阳和水族乡、基场水族乡、良亩乡、河阳乡、沙寨乡、石龙乡、摆忙乡。
2007年末，全市总面积2274平方千米，总人口48.38万人，其中少数民族人口33.42万人，非农业人口17.42万人。辖5个街道、10个镇、8个乡（其中3个民族乡），109个行政村、27个城市社区、9个驻乡（镇）居委会。
2010年第六次人口普查，都匀市常住总人口443721人，其中：广惠街道45713人，文峰街道42952人，新华街道31989人，小围寨街道49786人，沙包堡街道60065人，杨柳街镇10057人，甘塘镇21271人，洛邦镇12248人，坝固镇16025人，大坪镇21337人，王司镇18177人，墨冲镇15744人，平浪镇8605人，凯口镇9078人，江洲镇8513人，奉合水族乡5838人，阳和水族乡9441人，基场水族乡8731人，良亩乡10053人，河阳乡13152人，沙寨乡12013人，石龙乡6473人，摆忙乡6460人。2010年末，都匀市常住人口44.43万人。
2011年末，都匀市面积2274平方千米，常住人口44.04万人，户籍人口48.26万人，其中少数民族34.06万人，非农业人口16.69万人。辖5个街道、10个镇、8个乡（其中3个民族乡），27个社区、9个居委会、109个行政村。其中，都匀经济开发区管理洛邦、大坪2个镇，10个行政村、3个居委会，总面积252平方千米，总人口50508人，其中少数民族44453人，非农业人口10361人。
2013年，撤销新华街道，将新华社区、石板街社区民族路以北的区域和环西社区、西苑社区、剑北社区划归广惠街道管辖，新华社区、石板街社区民族路以南的区域划归文峰街道管辖。
2014年4月14日，省政府（黔府函[2014]80号）批复同意都匀市部分乡镇行政区划调整：撤销甘塘镇、河阳乡、小围寨街道、杨柳街镇，设置（新的）街道；撤销墨冲镇、沙寨乡、良亩乡，设置新的墨冲镇，镇政府驻墨冲村，将原良亩乡的苗拱村划入新设置的街道管辖；撤销平浪镇、凯口镇、石龙乡，设置新的平浪镇，镇政府驻平浪村；撤销江洲镇、摆忙乡，设置新的毛尖镇，镇政府驻江洲村；撤销王司镇、坝固镇、大坪镇、洛邦镇，设置新的匀东镇，镇政府驻大坪村；撤销奉合水族乡、阳和水族乡、基场水族乡，设置新的归兰水族乡，乡政府驻奉合村。
2014年5月13日，州政府（黔南府函[2014]66号）批复同意：设置文峰街道，街道办事处驻云宫社区，辖原小围寨街道的蒙家桥社区、庆云宫村，原文峰街道的云宫、文峰、西山、百子桥、新华、环东、龙潭7个社区；设置广惠街道，辖原小围寨街道的西园村，原广惠街道的广惠、环西、东山、平桥、西苑、大西门、钓鱼台、石板街8个社区；设置小围寨街道，辖原良亩乡的苗拱村，原小围寨街道的剑东、剑南、剑西3个社区和小围寨、沙井、王家司、团山、茶农、大河、马尾、三道河、栋青树9个村，原河阳乡的米秀、护德、展甲、普林、包阳、荣堡、各里7个村；设置沙包堡街道，辖原杨柳街镇的文德、德化2个村和杨柳街居委会，原沙包堡街道的龙昌、七星、观澜轩、谢官冲、虹桥5个社区和黄丰、茶园、龙江、迎恩、黄莺、剑水、剑江7个村；设置绿茵湖街道，辖原杨柳街镇的谷江、斗篷山2个村，原甘塘镇的绿茵湖、邦水、文明、胡广、林荫5个村和甘塘社区。
至此，全市辖5个街道、4个镇、1个民族乡：文峰街道、广惠街道、小围寨街道、沙包堡街道、绿茵湖街道、墨冲镇、平浪镇、毛尖镇、匀东镇、归兰水族乡。市政府驻广惠街道。其中，匀东镇由都匀经济开发区代管。