“百色”由“博涩寨”演变而来，系壮语，意为山川塞口地形复杂的地方。一说系壮语“拍洗衣服的地方”之意。据传在鹅江与澄碧河汇合处，有一无底深潭，岸边有村庄，村女经常在此洗衣，因而得名。
清置百色厅，1913年置县。1949年末置百色专区，治百色县。1956年3月改为百色地区，属桂西壮族自治州。1957年12月复置百色专区，1971年改百色地区。1983年10月8日，国务院批准（国函[1983]215号）撤销百色县，设立百色市，以原百色县的行政区域为百色市的行政区域。
2000年第五次全国人口普查,百色地区总人口3332096人。其中：百色市340483人、田阳县291973人、田东县360123人、平果县392800人、德保县276335人、靖西县456292人、那坡县170158人、凌云县175573人、乐业县144816人、田林县136799人、隆林各族自治县347462人、西林县139282人。
2002年6月2日，国务院批准（国函[2002]47号）同意广西壮族自治区撤销百色地区和县级百色市，设立地级百色市。市人民政府驻新设立的右江区。百色市设立右江区，以原县级百色市的行政区域为右江区的行政区域。区人民政府驻向阳路19号。百色市辖原百色地区的田东县、田阳县、平果县、德保县、靖西县、那坡县、凌云县、乐业县、西林县、田林县、隆林各族自治县和新设立的右江区。6月19日，自治区政府以桂政发[2002]32号转发国务院批文。
2005年，百色市撤并乡镇50个。其中：右江区5个、田阳县5个、田东县3个、平果县5个、德保县6个、靖西县5个、凌云县2个、隆林各族自治县5个、西林县3个。从6月8日起，全市正式启动实施乡镇撤并工作，并在6月底前完成。
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