1980年6月以临夏县的部分地区析置积石山保安族东乡族撒拉族自治县。县因境内积石山得名。
1996年，积石山保安族东乡族撒拉族自治县面积910平方千米，人口21.2万人，其中东乡、回、保安、撒拉族占48.6%。辖1个镇、17个乡：吹麻滩镇、四堡子乡、大河家乡、刘集乡、石塬乡、柳沟乡、关家川乡、安集乡、胡林家乡、寨子沟乡、居集乡、中嘴岭乡、徐扈家乡、郭干乡、银川乡、铺川乡、癿藏乡、小关乡。县政府驻吹麻滩镇。
2000年第五次人口普查，积石山保安族东乡族撒拉族自治县常住总人口216939人，其中，吹麻滩镇16586人，大河家镇12600人，四堡子乡10991人，刘集乡14927人，石源乡10523人，柳沟乡10770人，关家川乡12230人，胡林家乡12072人，安集乡14087人，寨子沟乡12454人，居集乡12563人，郭干乡6657人，徐扈家乡8808人，中咀岭乡10523人，小关乡9560人，癿藏乡13931人，铺川乡10761人，银川乡16896人。
2008年末，全县面积910平方千米，农业人口4.47万户22.88万人。辖4个镇、13个乡：吹麻滩镇、大河家镇、居集镇、癿藏镇、刘集乡、石塬乡、柳沟乡、关家川乡、胡林家乡、安集乡、寨子沟乡、郭干乡、徐扈家乡、中咀岭乡、小关乡、铺川乡、银川乡，145个行政村，1296个村民小组。
2010年第六次人口普查，积石山保安族东乡族撒拉族自治县常住总人口235698人，其中，吹麻滩镇26044人，大河家镇27955人，居集镇13134人，癿藏镇14720人，刘集乡15931人，石塬乡9583人，柳沟乡10894人，关家川乡11211人，胡林家乡12457人，安集乡12875人，寨子沟乡13276人，郭干乡6707人，徐扈家乡9413人，中咀岭乡11433人，小关乡10220人，铺川乡10601人，银川乡19244人。