玛曲县位于甘肃省南部，甘南州西南部。东北邻碌曲县，东、东南连四川省若尔盖县、阿坝县，南、西、西北连青海省甘德县、久治县、玛沁县、河南蒙古族自治县。总面积10190平方千米。总人口5万人（2013年）。全县辖1个镇、7个乡：尼玛镇、欧拉乡、欧拉秀玛乡、阿万仓乡、木西合乡、齐哈玛乡、采日玛乡、曼日吗乡。县政府驻尼玛镇，距省会兰州454千米。
地处青藏高原东端，地形东南至西北长、西南至东北窄，地势西北高、东南低，平均海拔在3300米以上。地貌由高山、山地、丘陵和河岸节地构成，主要山脉有蜿蜒北部的西倾山脉和横贯中部的阿尼玛卿山 （积石山）山脉。黄河经南、东、北三面环绕，形成“九曲黄河天下第一湾”，并流经本县433千米，其支流赛尔曲、郎曲、西曲、黑曲等过境。黄河沿岸多宽阔滩地，有甘南牧场、河曲马场等。还有黄河沙漠、鸭蛋岛、黄河中流砒柱、河心岛等景点。S204、S313公路过境。
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