2004年7月16日，重庆市政府（渝府[2004]180号）批复同意奉节县将81个乡镇调整为30个乡镇。其中，撤销前进、双潭、奇峰、天池、新城、九盘、曲龙、平皋、寂静、槽木、青莲、梅子、桃树、龙池、双店、建农、金凤、茅田、青正、大寨、野茶、罗汉、明水、黄村、高治、桃李、黄井、万胜、三江、合营、杨坪、黄泗、高雅、新治、马驿、范家、梅魁、上庄、金子、含瑞、新贺、荆竹、庙湾、石罐、九里、九树、尖峰、明堂、尖角、长凼、江南51个乡，保留岩湾、云雾土家族2个乡和永安、羊市2个镇行政辖区和政府驻地不变，调整白帝、草堂、汾河、康乐、大树、竹园、公平、朱衣、甲高、吐祥、青龙、兴隆、新民、永乐14个镇和平安、新政、红土、石岗、康坪、安坪、太和、龙桥土家族、长安土家族、五马、鹤峰、冯坪12个乡（共26个乡镇）辖区范围。调整后，乡镇平均面积为136.6平方千米，平均人口为3.4万人。
2004年末，全县户籍人口100.2万人，其中非农业人口10.1万人，城镇常住人口19.6万人。有土家、回、藏、苗、满、水、布依、仡佬等少数民族1.5万余人，占全县总人口1.7%。云雾、龙桥、长安3个土家族乡总面积393.5平方千米，占全县总面积的9.9%，总人口31483人，少数民族12560人，占民族乡总人口的40%。
2009年1月21日，重庆市政府（渝府[2009]17号）批复同意撤销太和乡，设立太和土家族乡。调整后，全县辖16个镇、14个乡（其中4个民族乡）：永安镇、白帝镇、草堂镇、汾河镇、康乐镇、大树镇、竹园镇、公平镇、朱衣镇、甲高镇、羊市镇、吐祥镇、兴隆镇、青龙镇、新民镇、永乐镇、岩湾乡、平安乡、红土乡、新政乡、石岗乡、康坪乡、五马乡、太和土家族乡、安坪乡、鹤峰乡、冯坪乡、长安土家族乡、龙桥土家族乡、云雾土家族乡。县政府驻永安镇。
2010年4月9日，重庆市政府（渝府[2010]26号）批复同意将永安镇白帝社区调整为白帝镇管辖。2010年6月23日，重庆市政府（渝府[2010]64号）批复同意撤销安坪乡、五马乡、新政乡，设立安坪镇、五马镇、青莲镇。调整后，奉节县辖19个镇、11个乡（其中4个民族乡）：永安镇、白帝镇、草堂镇、汾河镇、康乐镇、大树镇、竹园镇、公平镇、朱衣镇、甲高镇、羊市镇、吐祥镇、兴隆镇、青龙镇、新民镇、永乐镇、安坪镇、五马镇、青莲镇、岩湾乡、平安乡、红土乡、石岗乡、康坪乡、太和土家族乡、鹤峰乡、冯坪乡、长安土家族乡、龙桥土家族乡、云雾土家族乡。
2010年第六次人口普查，奉节县常住总人口834259人，其中：永安镇144314人，白帝镇30251人，草堂镇29647人，汾河镇32059人，康乐镇35521人，大树镇21793人，竹园镇39338人，公平镇38852人，朱衣镇55627人，甲高镇24407人，羊市镇10027人，吐祥镇41011人，兴隆镇41411人，青龙镇15335人，新民镇21912人，永乐镇22434人，岩湾乡8682人，平安乡13161人，红土乡14483人，新政乡26969人，石岗乡22126人，康坪乡8481人，五马乡25919人，太和土家族乡9784人，安坪乡24767人，鹤峰乡10614人，冯坪乡15497人，长安土家族乡11976人，龙桥土家族乡8609人，云雾土家族乡3287人，白帝城风景区管理委员会25965人。
2014年4月30日，重庆市政府（渝府[2014]25号）批复同意撤销永安镇；调整白帝镇、朱衣镇行政区域范围；设立夔门街道、鱼复街道和永安街道。调整后，奉节县辖3个街道、18个镇、11个乡（其中4个民族乡）：夔门街道、鱼复街道、永安街道、白帝镇、草堂镇、汾河镇、康乐镇、大树镇、竹园镇、公平镇、朱衣镇、甲高镇、羊市镇、吐祥镇、兴隆镇、青龙镇、新民镇、永乐镇、岩湾乡、平安乡、红土乡、新政乡、石岗乡、康坪乡、五马乡、太和土家族乡、安坪乡、鹤峰乡、冯坪乡、长安土家族乡、龙桥土家族乡、云雾土家族乡。
2015年6月17日，重庆市政府（渝府[2015]32号）批复同意奉节县人民政府驻地由永安街道县政路88号迁至永安街道朱衣路3号。因藕塘滑坡整体避险搬迁工作已全面启动，安坪镇政府驻地于6月搬迁至新址（下坝村敬老院）临时办公（7月1日起恢复正常办公秩序）。