1951年1月合肥市设两个郊区，11月合并为城郊区，1952年8月分为东郊区和西郊区，1955年1月又合并为城郊区；1960年3月改为蜀山区，6月改为北市区；1963年5月改为郊区。
1996年，郊区面积330平方千米，人口约38万人，辖1个街道7镇4乡：大兴镇、义城镇、七里塘镇、常青镇、杏花村镇、义兴镇、骆岗镇、城东乡、大圩乡、大杨店乡、三十岗乡。区政府驻濉溪路20号。
1997年，撤销大杨店乡，设立大杨镇，镇政府驻大杨店。调整后，郊区辖：瑶海街道、大兴镇、义城镇、七里塘镇、常青镇、杏花村镇、义兴镇、骆岗镇、大杨镇、城东乡、大圩乡、三十岗乡。
2000年第五次人口普查，郊区常住总人口779511人，其中：杏花村镇111959人，七里塘镇40559人，常青镇167359人，大兴镇36240人，大杨镇25385人，骆岗镇72925人，义兴镇35001人，义城镇24729人，城东乡73490人，大圩乡22572人，三十岗乡11761人，新站开发区30540人，高新区97956人，经济技术开发区35035人。（注：瑶海街道由新站开发区管辖）
2002年3月6日，根据国务院国函[2002]10号批复和省政府皖政秘[2002]13号文件精神，合肥市行政区划开始调整。其中：郊区更名为包河区。包河区辖原郊区的大圩1个乡，义兴、义城、骆岗、常青4个镇。从原西市区划入巢湖路、芜湖路、宁国路3个街道。原西市区稻香村、南七里站街道金寨路以东区域与原郊区常青镇金寨路以东区域合并，由常青镇政府管辖，镇政府驻地不变。原郊区城东乡分路口、周谷堆、五里庙3个村划归包河区骆岗镇管辖。调整后，包河区辖大圩1个乡，义兴、义城、骆岗、常青4个镇，巢湖路、芜湖路、宁国路3个街道。面积230.70平方千米，人口33.44万人，其中非农业人口22.05万人。区人民政府驻地暂驻濉溪路118号（原郊区人民政府驻地）。2002年底，包河区辖3个街道、4个镇、1个乡：巢湖路街道、宁国路街道、芜湖路街道、义城镇、常青镇、义兴镇、骆岗镇、大圩乡。
2004年，撤销骆岗镇，设立骆岗街道。调整后，包河区辖5个街道、2个镇、1个乡：常青街道、宁国路街道、芜湖路街道、巢湖路街道、骆岗街道、义兴镇、义城镇、大圩乡。
2006年，安徽省民政厅《关于同意将肥西县烟墩乡整建制划归合肥市包河区管辖的批复》（民地字[2006]71号）：同意将肥西县烟墩乡划归合肥市包河区管辖。包河区辖5个街道、2个镇、2个乡：巢湖路街道、宁国路街道、芜湖路街道、常青街道、骆岗街道、义城镇、义兴镇、大圩乡、烟墩乡。
2007年4月，合肥市对包河区行政区划进行调整：撤销2个街道、2个乡，新设2个街道、2个镇，并调整了3个街道的管辖范围。即撤销巢湖路、宁国路2个街道；调整芜湖路、骆岗、常青街道等3个管辖范围；新设立了包公街道、望湖路街道；调整义兴镇行政区域并将其更名为淝河镇；撤销大圩乡、烟墩乡，分别设立大圩镇、烟墩镇；保持义城镇行政区划不变。
2008年9月，经省政府同意，省民政厅作出批复，合肥市撤销包河区烟墩镇、义城镇，设立烟墩街道、义城街道。新设立的两个街道为包河区政府的派出机构，面积、人口不变。烟墩街道办事处驻原烟墩镇政府驻地；义城街道办事处驻原义城镇政府驻地（2009年10月28日正式撤镇改设街道）。
2010年第六次人口普查，包河区常住总人口817686人，其中：骆岗街道75955人，常青街道105575人，芜湖路街道133130人，包公街道105122人，望湖街道179924人，义城街道30329人，烟墩街道88075人，淝河镇78565人，大圩镇21011人。